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A Secretaria de Saúde tem por finalidade planejar, organizar, controlar e avaliar as ações e os serviços de saúde e gerir e executar os serviços públicos de saúde; participar do planejamento, programação e organização da rede regionalizada e hierarquizada do Sistema Único de Saúde (SUS), em articulação com sua direção estadual; participar da execução, controle e avaliação das ações referentes às condições e aos ambientes de trabalho.

Administrativamente o Departamento Municipal de Saúde subdividi-se em coordenadorias:

▶ Vigilância Sanitária
▶ Vigilância Epidemiológica
▶ Unidade de Avaliação e Controle
▶ Equipe Técnica de Auditoria Municipal
▶ Assistência Farmacêutica
▶ Atenção Básica e Média Complexidade
▶ Saúde Bucal
▶ Saúde da Mulher
▶ Serviço Social e Setor de Agendamento (consultas, exames e transporte)
▶ Administração
▶ Almoxarifado